Кафедра биоинформатики и математической биологии

заведующий кафедрой Роман Давыдов, кандидат физ.-мат. наук

Кафедра биоинформатики и математической биологии СПбАУ РАН им. Ж.И. Алферова осуществляет подготовку студентов по общеобразовательным курсам разделов математики, а также подготовку студентов по профилям обучения «Биоинформатика» и «Цифровая физика».

Биоинформатика — активно развивающееся междисциплинарное направление, объединяющая биологию, генетику, химию, компьютерные науки, математику и статистику и специализирующееся на крупномасштабных биологических проблемах, требующих анализа больших объемов данных. Эта область включает в себя изучение и разработку компьютерных методов и направлена на получение, анализ, хранение, организацию и визуализацию биологических данных.

 

Кафедра биоинформатики и математической биологии ведет подготовку специалистов всех трех ступеней обучения:

Бакалавриат

Профиль «Биоинформатика» (направление 03.03.01 — «Прикладные математика и физика»)

Профиль «Цифровая физика»

Магистратура

Профиль «Алгоритмическая биоинформатика» (направление 03.04.01 «Прикладные математика и физика»)

Аспирантура

Профиль «Математическая логика, алгебра и теория чисел» (направление 01.06.01 — «Математика и механика»

Профиль «Теоретические основы информатики» (направление 09.06.01 — «Информатика и вычислительная техника»)

Как поступить?

Преподаватели

Среди преподавателей кафедры — 3 профессора, в том числе член-корреспондент РАН, 9 доцентов, 5 старших преподавателей.

Подробнее о преподавателях

Базовые курсы

Обучение по профилю «Биоинформатика» предполагает углубленную подготовку в области теории алгоритмов и разработки программного обеспечения, наряду с которой студенты получают знания в области физики, химии и биологии, необходимые для анализа данных современной геномики, протеомики, транскриптомики и метаболомики. В учебные планы включены также курсы по математической, системной и структурной биологии, биотехнологии и биостатистике. Для чтения специальных курсов будут приглашаться эксперты международного уровня в соответствующих областях. 

Профиль "Цифровая физика" нацелен на подготовку специалистов в области математического моделирование физических процессов. Основой здесь, помимо серьезной базовой физико-математической подготовки, является глубокое изучение языков программирования, численных методов, дискретной математики, машинного обучения и специализированного программного обеспечения для моделирования. Студенты получают навыки построения, адаптации и анализа математических моделей в естественных науках, а также разработки программного обеспечения для осуществления вычислений и работы с данными.

Подробнее об образовательных программах

Трудоустройство

Студенты кафедры принимают участие в исследовательских проектах, реализуемых на базе лаборатории биоинформатики и математической биологии совместно  с Северо-западной Тихоокеанской национальной лабораторией (США), Медицинским центром университета Эразмус (Нидерланды), Высшей политехнической школы Лозанны (Швейцария) и другими ведущими научными центрами, а также с компаниями Spectroswiss (Швейцария) и CureLab Oncology (США). Планируется организация стажировок студентов в российских и зарубежных университетах и биотехнологических компаниях. Выпускники кафедры биоинформатики и математической биологии будут востребованы в различных областях науки и технологий, подразумевающих обработку данных биологии и медицины. По окончании магистратуры возможно продолжение обучения на кафедре в аспирантуре.