Кафедра биоинформатики и математической биологии

Описание кафедры

Кафедра биоинформатики и математической биологии СПбАУ РАН им. Ж.И. Алферова осуществляет подготовку студентов по общеобразовательным курсам разделов математики, а также подготовку студентов по профилям обучения «Биоинформатика» и «Цифровая физика».

Биоинформатика – активно развивающееся междисциплинарное направление, объединяющая биологию, генетику, химию, компьютерные науки, математику и статистику и специализирующееся на крупномасштабных биологических проблемах, требующих анализа больших объемов данных. Эта область включает в себя изучение и разработку компьютерных методов и направлена на получение, анализ, хранение, организацию и визуализацию биологических данных.

КАК ПОСТУПИТЬ?

  • Направления обучения

    Кафедра биоинформатики и математической биологии ведет подготовку специалистов всех трех ступеней обучения:

    Бакалавриат

    Профиль «Биоинформатика» (направление 03.03.01 – «Прикладные математика и физика»)

    Профиль «Цифровая физика»

    Магистратура

    Профиль «Алгоритмическая биоинформатика» (направление 03.04.01 – «Прикладные математика и физика»)

    Аспирантура

    Профиль «Математическая логика, алгебра и теория чисел» (направление 01.06.01 – «Математика и механика»

    Профиль «Теоретические основы информатики» (направление 09.06.01 – «Информатика и вычислительная техника»)

  • Базовые курсы

    Обучение по профилю «Биоинформатика» предполагает углубленную подготовку в области теории алгоритмов и разработки программного обеспечения, наряду с которой студенты получают знания в области физики, химии и биологии, необходимые для анализа данных современной геномики, протеомики, транскриптомики и метаболомики. В учебные планы включены также курсы по математической, системной и структурной биологии, биотехнологии и биостатистике. Для чтения специальных курсов будут приглашаться эксперты международного уровня в соответствующих областях.

    Профиль «Цифровая физика» нацелен на подготовку специалистов в области математического моделирование физических процессов. Основой здесь, помимо серьезной базовой физико-математической подготовки, является глубокое изучение языков программирования, численных методов, дискретной математики, машинного обучения и специализированного программного обеспечения для моделирования. Студенты получают навыки построения, адаптации и анализа математических моделей в естественных науках, а также разработки программного обеспечения для осуществления вычислений и работы с данными.

    Подробнее об образовательных программах
  • Трудоустройство

    Студенты кафедры принимают участие в исследовательских проектах, реализуемых на базе лаборатории биоинформатики и математической биологии совместно с Северо-западной Тихоокеанской национальной лабораторией (США), Медицинским центром университета Эразмус (Нидерланды), Высшей политехнической школы Лозанны (Швейцария) и другими ведущими научными центрами, а также с компаниями Spectroswiss (Швейцария) и CureLab Oncology (США). Планируется организация стажировок студентов в российских и зарубежных университетах и биотехнологических компаниях. Выпускники кафедры биоинформатики и математической биологии будут востребованы в различных областях науки и технологий, подразумевающих обработку данных биологии и медицины. По окончании магистратуры возможно продолжение обучения на кафедре в аспирантуре.

  • Профессорско-преподавательский состав
    Давыдов Роман Вадимович

    Должность:
    заведующий кафедрой, кафедра биоинформатики и математической биологии

    Учёная степень:
    кандидат физико-математических наук

    Преподаваемые дисциплины:
    Численные методы, гр. 202, 401

    Андреев Юрий Александрович

    Должность:
    преподаватель, кафедра биоинформатики и математической биологии

    Преподаваемые дисциплины:
    Машинное и глубинное обучение, Обучение с подкреплением, Анализ изображений.

    Евсюков Игорь Валерьевич

    Должность:
    старший преподаватель, кафедра биоинформатики и математической биологии

    Преподаваемые дисциплины:
    Введение в биоинформатику, Биоинформатика рака

    Зайцева Анна Юрьевна

    Должность:
    доцент, кафедра биоинформатики и математической биологии

    Учёная степень:
    кандидат физико-математических наук

    Преподаваемые дисциплины:
    Сенсорные системы для медико-биологических исследований, гр. 604

    Крашенинников Сергей Вениаминович

    Должность:
    доцент, кафедра биоинформатики и математической биологии

    Учёная степень:
    кандидат физико-математических наук

    Учёное звание:
    Старший научный сотрудник

    Преподаваемые дисциплины:
    Операционная система Unix (лекции и практика), C и C++, Программирование для WEB, Параллельное программирование, гр. 102, 202, 302

    Степанова Анастасия Борисовна

    Должность:
    доцент, кафедра биоинформатики и математической биологии

    Учёная степень:
    кандидат биологических наук

    Учёное звание:
    доцент

    Преподаваемые дисциплины:
    Экобезопасность при проведении исследований в области БИ и БТ, методология СБ

    Устинов Александр Борисович

    Должность:
    доцент, кафедра биоинформатики и математической биологии

    Учёная степень:

    Учёное звание:

    Преподаваемые дисциплины:
    Python (лекция и практика), Разработка пользовательского интерфейса, гр. 101, 102, 302