Биоинформатический анализ масс-спектрометрических данных антител

Антитела – это белковые соединения, вырабатываемые иммунной системой в ответ на появление в организме чужеродных веществ, называемых антигенами. Анализ антител может использоваться для диагностики различных заболеваний, включая онкологические; кроме того, антитела являются основой ряда эффективных лекарственных препаратов нового поколения.

Для установления первичной структуры антител, как правило, используется масс-спектрометрия. Современные масс-спектрометры позволяют получать данные высокого качества как в случае применения технологии масс-спектрометрии «снизу вверх», в соответствии с которой белки перед анализом расщепляются на пептиды, так и при использовании технологии «сверху вниз», позволяющей анализировать белковые молекулы целиком. Снятые в ходе эксперимента масс-спектры обрабатываются и интерпретируются с использованием специальных программных инструментов.

В ходе работы над проектом участники

• познакомятся с особенностями первичной структуры антител;
• изучат основные принципы масс-спектрометрии белков и пептидов;
• научатся работать с программными средствами для идентификации белков и пептидов;
• самостоятельно проанализируют данные масс-спектрометрии высокого разрешения для моноклональных антител, используемых в медицинской практике.

Руководитель – Вяткина Кира