SARS-CoV-2 в наши дни

В 2019 году в китайском Ухане началось распространение нового коронавируса SARS-cov-2, переросшее в пандемию. Геном первоначального штамма был быстро расшифрован и предоставлен общественности, что позволило отслеживать развитие нового патогена, начиная почти с самого его появления.

К настоящему времени медийный ажиотаж вокруг новой эпидемии стих, однако вирус не только не перестал мутировать, но и открыл для себя новые зоонозные резервуары. Открытым остается вопрос – когда ждать возвращения “короны”?

Ученые продолжают следить за эволюцией генома SARS-CoV-2, а основным объектом изучения остаются геномные мутации. Занятно, что сама методика определения мутаций по данным секвенирования переживает бурное развитие в последние годы, уже после пика эпидемии.

Исследованием происхождения, эволюции и взаимодействия геномов занимается интереснейшая область вычислительной биологии – сравнительная геномика. Феномен нового коронавируса дает возможность познакомиться с этой областью вплотную, на живом примере.

В данном проекте мы применим современные методы определения мутаций,  недоступные в годы развития эпидемии, и определим мутации SARS-CoV-2, актуальные на сегодняшний день. Также мы попытаемся предположить механизм современных приспособлений вируса к отбору.

Приняв участие в данном проекте Вы научитесь 
●   Определять мутации и структурные вариации геномов вирусов
●   Оценивать сходства геномов разных вариантов вирусов; 
●   Находить явлений горизонтального переноса генов для адаптации паразита к хозяину;
●   Проводить филогенетический анализ и реконструировать эволюцию геномов вирусов и их отдельных элементов.